2022年3月16日，北京大学党委任命马玉国为北大附中党委副书记、校长。实行党委领导的校长负责制。
2022年7月，北大附中实验学校转入由北京大学举办的北大附中公办校，校名不单独存在。
2022年8月底，北大附中2022年暑期战略研讨会，会议以“苦炼内功、提升品质，凝心聚力、再创辉煌”为主题，聚焦新的发展阶段下学校在教学和管理等方面工作的重点与挑战。

2010 年，学校设定全新架构制度，高中部打破行政班，施行走班制、学段制，并设立单元制、导师制、学长制。同年，成立国际部道尔顿学院，专门培养出国留学方向的学生。
2010年10月6日，北大附中举行了50周年校庆，三千多名校友返校，欢聚母校。
2015年，预科部建成自主备考，分层分类课程教学模式。
2016年，欣健体育馆落成。
2017年，北大附中教育集团总校成立。
2018年，初中部正式加入元培学院人才培养1+3项目，建立初高衔接的课程体系和自主学习课程体系。
2019年4月，北达资源中学变更举办者。同时，学校更名为北大附中实验学校。

2002年9月，北大附中教学西楼正式启用，总建筑面积达14900平方米。
2003年3月，第二届北大附中附小远程教育合作示范校年会在北京人民大会堂隆重举行。
2003年6月，学校接收北京市教委颁发的北京市示范性普通高中校牌。
2007年1月，学校召开了推进新课标实施的专题研讨会。
2008年3月，在奥运会乒乓球比赛场馆，北大附中500多名高三学生和父母、师长一起参加成人仪式。
2009年12月，北京大学图书馆附属中学图书馆分馆成立。

1997年7月，北京大学党委和校长根据北京大学的发展规划，决定将北大二附中与北大附中合并成新北大附中，并任命合并后北大附中的新一届校级领导班子.
1998年4月，由北京大学资源集团申办，北大附中承办的北达资源中学成立，校址位于北京大学畅春园，学校实施校董事会领导下的校长负责制。
2000年11月北大附中远程教育网创办，同时成立了全国校际联盟。
2001年，北大附中等六所部属中学根据教育部会议精神，为满足广大群众对优质高中的强烈需求，实施扩大高中规模计划。

教学上继承北大"兼容并包，学术自由"的传统。全面推进素质教育，北大附中人才培养模式构建逐步完善。
1994年，北大附中设国家教委委办的三年制理科实验班。
1997年，北大二附中与北大附中合并成新北大附中，设直升北大实验班。

1987年，北大附中开始进行小学、中学衔接试验，试办初、高中试验班。
1988年，北大附中设国家教委委办的物理实验班和化学实验班。多名同学在国际奥林匹克竞赛中取得佳绩。
1990年，北大附中“金帆”管乐团成立。

1984年5月：两校合并。
1985年1月：恢复二附中建制。
1985年，实行校长负责制，学校着手整体教育改革，在基础教育特别是培养特长生、尖子生方面取得了显著成绩。

1981年3月：成立北大附中分校。
1982年以每周4-5节体育课为突破口，进行体育课教学改革。
1983年10月：更名北大二附中。

70年代末，学校认真落实政策，建立正常教学秩序。70年代末和整个80年代是北大附中走向辉煌的黄金时期。
1977年恢复高考后越级考入高校学生15人，居北京市中学之首。
1978年北大附中被确定为“北京市首批重点中学”。
1979年3月：建立北大附中二部。
1979年语文组教改试验，将《语言与思维训练》引入写作教学，将《当代文学讲座》引入课堂，进行小论文写作实验。

在特殊历史时期，附中办学的信念和目标都没有变，老师们虽然身处逆境，仍坚守岗位，边劳动边教学。

北大党委任命刘美德同志为常务副校长兼党支部书记。学校认真贯彻教育方针，进行革命传统教育，注意劳动技能培养，教育与生产劳动相结合。从大学各系先后选派了43名青年助教、讲师来校任教。为北大附中的创立和发展奠定了基础。

北大附中创建于1960年。前身是以原清华工农速成中学为基础而组建的北京市第104中学。在北京大学党委书记、校长陆平的领导与关怀下，为解决大学与中学教育的衔接问题，实现“小学、中学、大学本科、研究生院”四级办学目标，决定正式创办北大附中。北大党委任命副教务长尹企卓兼任北京大学附属中学校长。